Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Zfr-201ENSMUST00000122941 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 1700007F19Rik-201ENSMUST00000188418 1642 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Flii-201ENSMUST00000002889 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Cacna1c-213ENSMUST00000188078 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Cacna1c-217ENSMUST00000188865 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Ggct-202ENSMUST00000131475 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Cd101-201ENSMUST00000147399 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Hsp90aa1-202ENSMUST00000094361 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Smcr8-201ENSMUST00000056907 7391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm45767-201ENSMUST00000212778 4561 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Sbf2-201ENSMUST00000033058 7154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Tmed5-205ENSMUST00000119437 3436 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Tnfsf15-201ENSMUST00000062246 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Mink1-204ENSMUST00000102558 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Alox8-201ENSMUST00000021262 3226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Akap2-202ENSMUST00000098064 7172 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Atp9a-202ENSMUST00000109175 3729 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Trpm8-201ENSMUST00000040210 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Chordc1-201ENSMUST00000001825 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Ciao1-201ENSMUST00000003759 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Zic4-201ENSMUST00000066384 3891 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Arhgap27-201ENSMUST00000041385 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 AC121860.1-201ENSMUST00000227908 2787 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Efr3a-213ENSMUST00000211878 2541 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Phf8-201ENSMUST00000046950 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Hnrnpk-221ENSMUST00000177497 2585 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm45354-201ENSMUST00000199820 2557 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 I830077J02Rik-201ENSMUST00000098758 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Rnf141-204ENSMUST00000175981 2333 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Myt1l-205ENSMUST00000218583 4522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Snrnp200-201ENSMUST00000103220 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm26953-209ENSMUST00000213051 2087 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Tifab-202ENSMUST00000225063 2718 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Cpne5-201ENSMUST00000024805 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms