Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrit3W8DXL4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrit3W8DXL4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms