Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vstm4T1NXB5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vstm4T1NXB5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vstm4T1NXB5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vstm4T1NXB5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vstm4T1NXB5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vstm4T1NXB5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vstm4T1NXB5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Vstm4T1NXB5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vstm4T1NXB5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vstm4T1NXB5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vstm4T1NXB5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vstm4T1NXB5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vstm4T1NXB5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vstm4T1NXB5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vstm4T1NXB5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vstm4T1NXB5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vstm4T1NXB5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vstm4T1NXB5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vstm4T1NXB5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Vstm4T1NXB5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vstm4T1NXB5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vstm4T1NXB5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vstm4T1NXB5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Vstm4T1NXB5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vstm4T1NXB5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vstm4T1NXB5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vstm4T1NXB5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vstm4T1NXB5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vstm4T1NXB5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vstm4T1NXB5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vstm4T1NXB5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vstm4T1NXB5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vstm4T1NXB5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vstm4T1NXB5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vstm4T1NXB5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vstm4T1NXB5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vstm4T1NXB5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vstm4T1NXB5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vstm4T1NXB5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vstm4T1NXB5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vstm4T1NXB5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vstm4T1NXB5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vstm4T1NXB5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vstm4T1NXB5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vstm4T1NXB5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vstm4T1NXB5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms