Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt27Q9Z320 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt27Q9Z320 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Krt27Q9Z320 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt27Q9Z320 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt27Q9Z320 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt27Q9Z320 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt27Q9Z320 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt27Q9Z320 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt27Q9Z320 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt27Q9Z320 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt27Q9Z320 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt27Q9Z320 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt27Q9Z320 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt27Q9Z320 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt27Q9Z320 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt27Q9Z320 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt27Q9Z320 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt27Q9Z320 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Krt27Q9Z320 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Krt27Q9Z320 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Krt27Q9Z320 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt27Q9Z320 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Krt27Q9Z320 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Krt27Q9Z320 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Krt27Q9Z320 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Krt27Q9Z320 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Krt27Q9Z320 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms