Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W9

Gria3, Glutamate receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria3Q9Z2W9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gria3Q9Z2W9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gria3Q9Z2W9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gria3Q9Z2W9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gria3Q9Z2W9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gria3Q9Z2W9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gria3Q9Z2W9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gria3Q9Z2W9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gria3Q9Z2W9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gria3Q9Z2W9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gria3Q9Z2W9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gria3Q9Z2W9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gria3Q9Z2W9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gria3Q9Z2W9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gria3Q9Z2W9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gria3Q9Z2W9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gria3Q9Z2W9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gria3Q9Z2W9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gria3Q9Z2W9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gria3Q9Z2W9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gria3Q9Z2W9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gria3Q9Z2W9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gria3Q9Z2W9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gria3Q9Z2W9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gria3Q9Z2W9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gria3Q9Z2W9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gria3Q9Z2W9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gria3Q9Z2W9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gria3Q9Z2W9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gria3Q9Z2W9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gria3Q9Z2W9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gria3Q9Z2W9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gria3Q9Z2W9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gria3Q9Z2W9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gria3Q9Z2W9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gria3Q9Z2W9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gria3Q9Z2W9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gria3Q9Z2W9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gria3Q9Z2W9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms