Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Robo3Q9Z2I4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Robo3Q9Z2I4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Robo3Q9Z2I4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Robo3Q9Z2I4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Robo3Q9Z2I4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Robo3Q9Z2I4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Robo3Q9Z2I4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Robo3Q9Z2I4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Robo3Q9Z2I4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Robo3Q9Z2I4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Robo3Q9Z2I4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Robo3Q9Z2I4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Robo3Q9Z2I4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Robo3Q9Z2I4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Robo3Q9Z2I4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Robo3Q9Z2I4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Robo3Q9Z2I4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Robo3Q9Z2I4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Robo3Q9Z2I4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Robo3Q9Z2I4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Robo3Q9Z2I4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Robo3Q9Z2I4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Robo3Q9Z2I4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Robo3Q9Z2I4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Robo3Q9Z2I4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Robo3Q9Z2I4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Robo3Q9Z2I4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Robo3Q9Z2I4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Robo3Q9Z2I4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms