Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C4

Mtmr1, Myotubularin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr1Q9Z2C4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mtmr1Q9Z2C4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mtmr1Q9Z2C4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mtmr1Q9Z2C4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Mtmr1Q9Z2C4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mtmr1Q9Z2C4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mtmr1Q9Z2C4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mtmr1Q9Z2C4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mtmr1Q9Z2C4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mtmr1Q9Z2C4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mtmr1Q9Z2C4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mtmr1Q9Z2C4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mtmr1Q9Z2C4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mtmr1Q9Z2C4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mtmr1Q9Z2C4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mtmr1Q9Z2C4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mtmr1Q9Z2C4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mtmr1Q9Z2C4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mtmr1Q9Z2C4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mtmr1Q9Z2C4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mtmr1Q9Z2C4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mtmr1Q9Z2C4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mtmr1Q9Z2C4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mtmr1Q9Z2C4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Mtmr1Q9Z2C4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mtmr1Q9Z2C4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mtmr1Q9Z2C4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mtmr1Q9Z2C4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mtmr1Q9Z2C4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mtmr1Q9Z2C4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mtmr1Q9Z2C4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Mtmr1Q9Z2C4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Mtmr1Q9Z2C4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mtmr1Q9Z2C4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mtmr1Q9Z2C4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mtmr1Q9Z2C4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mtmr1Q9Z2C4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mtmr1Q9Z2C4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mtmr1Q9Z2C4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mtmr1Q9Z2C4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mtmr1Q9Z2C4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mtmr1Q9Z2C4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mtmr1Q9Z2C4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mtmr1Q9Z2C4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Mtmr1Q9Z2C4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mtmr1Q9Z2C4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mtmr1Q9Z2C4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mtmr1Q9Z2C4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mtmr1Q9Z2C4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mtmr1Q9Z2C4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mtmr1Q9Z2C4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mtmr1Q9Z2C4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Mtmr1Q9Z2C4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mtmr1Q9Z2C4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mtmr1Q9Z2C4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mtmr1Q9Z2C4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mtmr1Q9Z2C4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mtmr1Q9Z2C4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mtmr1Q9Z2C4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mtmr1Q9Z2C4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mtmr1Q9Z2C4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mtmr1Q9Z2C4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mtmr1Q9Z2C4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mtmr1Q9Z2C4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mtmr1Q9Z2C4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mtmr1Q9Z2C4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mtmr1Q9Z2C4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mtmr1Q9Z2C4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mtmr1Q9Z2C4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mtmr1Q9Z2C4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Mtmr1Q9Z2C4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Mtmr1Q9Z2C4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mtmr1Q9Z2C4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mtmr1Q9Z2C4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mtmr1Q9Z2C4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mtmr1Q9Z2C4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mtmr1Q9Z2C4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms