Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N7

Arid3b, AT-rich interactive domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid3bQ9Z1N7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arid3bQ9Z1N7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arid3bQ9Z1N7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arid3bQ9Z1N7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arid3bQ9Z1N7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arid3bQ9Z1N7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arid3bQ9Z1N7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arid3bQ9Z1N7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arid3bQ9Z1N7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Arid3bQ9Z1N7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arid3bQ9Z1N7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arid3bQ9Z1N7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arid3bQ9Z1N7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arid3bQ9Z1N7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arid3bQ9Z1N7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arid3bQ9Z1N7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arid3bQ9Z1N7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arid3bQ9Z1N7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arid3bQ9Z1N7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Arid3bQ9Z1N7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Arid3bQ9Z1N7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arid3bQ9Z1N7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arid3bQ9Z1N7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arid3bQ9Z1N7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arid3bQ9Z1N7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arid3bQ9Z1N7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arid3bQ9Z1N7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arid3bQ9Z1N7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arid3bQ9Z1N7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Arid3bQ9Z1N7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Arid3bQ9Z1N7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Arid3bQ9Z1N7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Arid3bQ9Z1N7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Arid3bQ9Z1N7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Arid3bQ9Z1N7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Arid3bQ9Z1N7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Arid3bQ9Z1N7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arid3bQ9Z1N7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms