Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfrp4Q9Z1N6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfrp4Q9Z1N6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms