Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syngr4Q9Z1L2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Syngr4Q9Z1L2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Syngr4Q9Z1L2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syngr4Q9Z1L2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syngr4Q9Z1L2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syngr4Q9Z1L2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syngr4Q9Z1L2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Syngr4Q9Z1L2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms