Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1D9

Znf394, Zinc finger protein 394, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf394Q9Z1D9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Znf394Q9Z1D9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf394Q9Z1D9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf394Q9Z1D9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf394Q9Z1D9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf394Q9Z1D9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf394Q9Z1D9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf394Q9Z1D9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf394Q9Z1D9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf394Q9Z1D9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf394Q9Z1D9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf394Q9Z1D9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms