Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y9

Nr1h3, Oxysterols receptor LXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h3Q9Z0Y9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr1h3Q9Z0Y9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr1h3Q9Z0Y9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr1h3Q9Z0Y9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr1h3Q9Z0Y9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr1h3Q9Z0Y9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr1h3Q9Z0Y9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nr1h3Q9Z0Y9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr1h3Q9Z0Y9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr1h3Q9Z0Y9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr1h3Q9Z0Y9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr1h3Q9Z0Y9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr1h3Q9Z0Y9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr1h3Q9Z0Y9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr1h3Q9Z0Y9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr1h3Q9Z0Y9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr1h3Q9Z0Y9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr1h3Q9Z0Y9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nr1h3Q9Z0Y9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr1h3Q9Z0Y9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr1h3Q9Z0Y9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr1h3Q9Z0Y9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr1h3Q9Z0Y9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr1h3Q9Z0Y9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nr1h3Q9Z0Y9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nr1h3Q9Z0Y9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nr1h3Q9Z0Y9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nr1h3Q9Z0Y9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nr1h3Q9Z0Y9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nr1h3Q9Z0Y9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nr1h3Q9Z0Y9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nr1h3Q9Z0Y9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nr1h3Q9Z0Y9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nr1h3Q9Z0Y9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nr1h3Q9Z0Y9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nr1h3Q9Z0Y9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nr1h3Q9Z0Y9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nr1h3Q9Z0Y9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nr1h3Q9Z0Y9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms