Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Dctn3Q9Z0Y1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dctn3Q9Z0Y1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms