Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
AFG3L2Q9Y4W6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AFG3L2Q9Y4W6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AFG3L2Q9Y4W6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AFG3L2Q9Y4W6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AFG3L2Q9Y4W6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AFG3L2Q9Y4W6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
AFG3L2Q9Y4W6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AFG3L2Q9Y4W6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AFG3L2Q9Y4W6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AFG3L2Q9Y4W6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AFG3L2Q9Y4W6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AFG3L2Q9Y4W6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AFG3L2Q9Y4W6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AFG3L2Q9Y4W6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
AFG3L2Q9Y4W6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AFG3L2Q9Y4W6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
AFG3L2Q9Y4W6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AFG3L2Q9Y4W6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AFG3L2Q9Y4W6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AFG3L2Q9Y4W6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AFG3L2Q9Y4W6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AFG3L2Q9Y4W6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AFG3L2Q9Y4W6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AFG3L2Q9Y4W6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AFG3L2Q9Y4W6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AFG3L2Q9Y4W6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AFG3L2Q9Y4W6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AFG3L2Q9Y4W6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AFG3L2Q9Y4W6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AFG3L2Q9Y4W6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AFG3L2Q9Y4W6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
AFG3L2Q9Y4W6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AFG3L2Q9Y4W6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
AFG3L2Q9Y4W6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
AFG3L2Q9Y4W6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AFG3L2Q9Y4W6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
AFG3L2Q9Y4W6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AFG3L2Q9Y4W6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
AFG3L2Q9Y4W6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
AFG3L2Q9Y4W6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
AFG3L2Q9Y4W6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
AFG3L2Q9Y4W6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AFG3L2Q9Y4W6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms