Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVK8

Cyp46a1, Cholesterol 24-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp46a1Q9WVK8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp46a1Q9WVK8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp46a1Q9WVK8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp46a1Q9WVK8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp46a1Q9WVK8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp46a1Q9WVK8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp46a1Q9WVK8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp46a1Q9WVK8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp46a1Q9WVK8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp46a1Q9WVK8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp46a1Q9WVK8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp46a1Q9WVK8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp46a1Q9WVK8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp46a1Q9WVK8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp46a1Q9WVK8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp46a1Q9WVK8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp46a1Q9WVK8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp46a1Q9WVK8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp46a1Q9WVK8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp46a1Q9WVK8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp46a1Q9WVK8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp46a1Q9WVK8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp46a1Q9WVK8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp46a1Q9WVK8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp46a1Q9WVK8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp46a1Q9WVK8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp46a1Q9WVK8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp46a1Q9WVK8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp46a1Q9WVK8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp46a1Q9WVK8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp46a1Q9WVK8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp46a1Q9WVK8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp46a1Q9WVK8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp46a1Q9WVK8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp46a1Q9WVK8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp46a1Q9WVK8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp46a1Q9WVK8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp46a1Q9WVK8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp46a1Q9WVK8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp46a1Q9WVK8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp46a1Q9WVK8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp46a1Q9WVK8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp46a1Q9WVK8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp46a1Q9WVK8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp46a1Q9WVK8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp46a1Q9WVK8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp46a1Q9WVK8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp46a1Q9WVK8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp46a1Q9WVK8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp46a1Q9WVK8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp46a1Q9WVK8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp46a1Q9WVK8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp46a1Q9WVK8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp46a1Q9WVK8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp46a1Q9WVK8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp46a1Q9WVK8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp46a1Q9WVK8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp46a1Q9WVK8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp46a1Q9WVK8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp46a1Q9WVK8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp46a1Q9WVK8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp46a1Q9WVK8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp46a1Q9WVK8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp46a1Q9WVK8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp46a1Q9WVK8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp46a1Q9WVK8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp46a1Q9WVK8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp46a1Q9WVK8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp46a1Q9WVK8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp46a1Q9WVK8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp46a1Q9WVK8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp46a1Q9WVK8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp46a1Q9WVK8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp46a1Q9WVK8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp46a1Q9WVK8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyp46a1Q9WVK8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyp46a1Q9WVK8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyp46a1Q9WVK8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyp46a1Q9WVK8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyp46a1Q9WVK8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyp46a1Q9WVK8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cyp46a1Q9WVK8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cyp46a1Q9WVK8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cyp46a1Q9WVK8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cyp46a1Q9WVK8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cyp46a1Q9WVK8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyp46a1Q9WVK8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyp46a1Q9WVK8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyp46a1Q9WVK8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp46a1Q9WVK8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp46a1Q9WVK8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp46a1Q9WVK8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp46a1Q9WVK8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp46a1Q9WVK8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp46a1Q9WVK8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp46a1Q9WVK8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp46a1Q9WVK8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp46a1Q9WVK8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp46a1Q9WVK8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp46a1Q9WVK8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms