Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp1a4Q9WV27 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp1a4Q9WV27 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp1a4Q9WV27 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp1a4Q9WV27 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp1a4Q9WV27 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp1a4Q9WV27 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp1a4Q9WV27 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp1a4Q9WV27 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp1a4Q9WV27 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp1a4Q9WV27 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp1a4Q9WV27 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp1a4Q9WV27 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp1a4Q9WV27 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp1a4Q9WV27 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp1a4Q9WV27 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp1a4Q9WV27 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp1a4Q9WV27 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp1a4Q9WV27 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp1a4Q9WV27 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1a4Q9WV27 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1a4Q9WV27 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1a4Q9WV27 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1a4Q9WV27 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1a4Q9WV27 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1a4Q9WV27 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1a4Q9WV27 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1a4Q9WV27 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1a4Q9WV27 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp1a4Q9WV27 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp1a4Q9WV27 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp1a4Q9WV27 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp1a4Q9WV27 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp1a4Q9WV27 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp1a4Q9WV27 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp1a4Q9WV27 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp1a4Q9WV27 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp1a4Q9WV27 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp1a4Q9WV27 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp1a4Q9WV27 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp1a4Q9WV27 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp1a4Q9WV27 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp1a4Q9WV27 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp1a4Q9WV27 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1a4Q9WV27 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1a4Q9WV27 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1a4Q9WV27 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1a4Q9WV27 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1a4Q9WV27 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1a4Q9WV27 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp1a4Q9WV27 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp1a4Q9WV27 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp1a4Q9WV27 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp1a4Q9WV27 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp1a4Q9WV27 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp1a4Q9WV27 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp1a4Q9WV27 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp1a4Q9WV27 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp1a4Q9WV27 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp1a4Q9WV27 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp1a4Q9WV27 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp1a4Q9WV27 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp1a4Q9WV27 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp1a4Q9WV27 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp1a4Q9WV27 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp1a4Q9WV27 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp1a4Q9WV27 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp1a4Q9WV27 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp1a4Q9WV27 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp1a4Q9WV27 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp1a4Q9WV27 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp1a4Q9WV27 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp1a4Q9WV27 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp1a4Q9WV27 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp1a4Q9WV27 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp1a4Q9WV27 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atp1a4Q9WV27 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1a4Q9WV27 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1a4Q9WV27 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1a4Q9WV27 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1a4Q9WV27 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1a4Q9WV27 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1a4Q9WV27 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1a4Q9WV27 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atp1a4Q9WV27 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1a4Q9WV27 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1a4Q9WV27 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1a4Q9WV27 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1a4Q9WV27 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1a4Q9WV27 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1a4Q9WV27 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms