Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP4

Srd5a3, Polyprenol reductase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srd5a3Q9WUP4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srd5a3Q9WUP4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srd5a3Q9WUP4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srd5a3Q9WUP4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srd5a3Q9WUP4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srd5a3Q9WUP4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srd5a3Q9WUP4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srd5a3Q9WUP4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srd5a3Q9WUP4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srd5a3Q9WUP4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srd5a3Q9WUP4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srd5a3Q9WUP4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srd5a3Q9WUP4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srd5a3Q9WUP4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srd5a3Q9WUP4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srd5a3Q9WUP4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srd5a3Q9WUP4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srd5a3Q9WUP4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Srd5a3Q9WUP4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srd5a3Q9WUP4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srd5a3Q9WUP4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srd5a3Q9WUP4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srd5a3Q9WUP4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srd5a3Q9WUP4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srd5a3Q9WUP4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms