Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUF3

Casp8ap2, CASP8-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,962 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8ap2Q9WUF3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Casp8ap2Q9WUF3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casp8ap2Q9WUF3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Casp8ap2Q9WUF3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Casp8ap2Q9WUF3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Casp8ap2Q9WUF3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casp8ap2Q9WUF3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Casp8ap2Q9WUF3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Casp8ap2Q9WUF3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casp8ap2Q9WUF3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casp8ap2Q9WUF3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casp8ap2Q9WUF3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casp8ap2Q9WUF3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Casp8ap2Q9WUF3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Casp8ap2Q9WUF3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Casp8ap2Q9WUF3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Casp8ap2Q9WUF3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Casp8ap2Q9WUF3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Casp8ap2Q9WUF3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Casp8ap2Q9WUF3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Casp8ap2Q9WUF3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Casp8ap2Q9WUF3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Casp8ap2Q9WUF3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Casp8ap2Q9WUF3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Casp8ap2Q9WUF3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Casp8ap2Q9WUF3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Casp8ap2Q9WUF3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Casp8ap2Q9WUF3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casp8ap2Q9WUF3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casp8ap2Q9WUF3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casp8ap2Q9WUF3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casp8ap2Q9WUF3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casp8ap2Q9WUF3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casp8ap2Q9WUF3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casp8ap2Q9WUF3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casp8ap2Q9WUF3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casp8ap2Q9WUF3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casp8ap2Q9WUF3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casp8ap2Q9WUF3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casp8ap2Q9WUF3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Casp8ap2Q9WUF3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Casp8ap2Q9WUF3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms