Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Stub1Q9WUD1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stub1Q9WUD1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms