Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp18Q9WTV6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp18Q9WTV6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms