Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PplQ9R269 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PplQ9R269 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PplQ9R269 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PplQ9R269 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PplQ9R269 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PplQ9R269 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PplQ9R269 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PplQ9R269 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PplQ9R269 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PplQ9R269 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PplQ9R269 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PplQ9R269 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PplQ9R269 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PplQ9R269 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PplQ9R269 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PplQ9R269 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PplQ9R269 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PplQ9R269 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PplQ9R269 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PplQ9R269 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PplQ9R269 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PplQ9R269 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PplQ9R269 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PplQ9R269 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PplQ9R269 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PplQ9R269 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PplQ9R269 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PplQ9R269 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PplQ9R269 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PplQ9R269 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PplQ9R269 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PplQ9R269 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PplQ9R269 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PplQ9R269 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PplQ9R269 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PplQ9R269 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PplQ9R269 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PplQ9R269 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PplQ9R269 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PplQ9R269 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PplQ9R269 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PplQ9R269 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PplQ9R269 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PplQ9R269 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PplQ9R269 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PplQ9R269 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PplQ9R269 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PplQ9R269 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PplQ9R269 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PplQ9R269 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PplQ9R269 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PplQ9R269 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PplQ9R269 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PplQ9R269 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PplQ9R269 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PplQ9R269 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PplQ9R269 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PplQ9R269 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PplQ9R269 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PplQ9R269 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PplQ9R269 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PplQ9R269 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PplQ9R269 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PplQ9R269 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PplQ9R269 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PplQ9R269 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PplQ9R269 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PplQ9R269 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PplQ9R269 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PplQ9R269 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PplQ9R269 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PplQ9R269 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PplQ9R269 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PplQ9R269 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PplQ9R269 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PplQ9R269 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PplQ9R269 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PplQ9R269 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PplQ9R269 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PplQ9R269 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PplQ9R269 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PplQ9R269 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PplQ9R269 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PplQ9R269 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PplQ9R269 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PplQ9R269 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PplQ9R269 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PplQ9R269 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PplQ9R269 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PplQ9R269 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PplQ9R269 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PplQ9R269 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PplQ9R269 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PplQ9R269 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PplQ9R269 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PplQ9R269 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PplQ9R269 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PplQ9R269 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PplQ9R269 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms