Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Y8

Gabrg1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrg1Q9R0Y8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabrg1Q9R0Y8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gabrg1Q9R0Y8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gabrg1Q9R0Y8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gabrg1Q9R0Y8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabrg1Q9R0Y8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabrg1Q9R0Y8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabrg1Q9R0Y8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabrg1Q9R0Y8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabrg1Q9R0Y8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabrg1Q9R0Y8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabrg1Q9R0Y8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabrg1Q9R0Y8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabrg1Q9R0Y8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabrg1Q9R0Y8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabrg1Q9R0Y8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabrg1Q9R0Y8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabrg1Q9R0Y8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabrg1Q9R0Y8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabrg1Q9R0Y8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabrg1Q9R0Y8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabrg1Q9R0Y8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabrg1Q9R0Y8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabrg1Q9R0Y8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabrg1Q9R0Y8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabrg1Q9R0Y8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabrg1Q9R0Y8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabrg1Q9R0Y8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabrg1Q9R0Y8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabrg1Q9R0Y8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabrg1Q9R0Y8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabrg1Q9R0Y8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabrg1Q9R0Y8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabrg1Q9R0Y8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabrg1Q9R0Y8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabrg1Q9R0Y8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabrg1Q9R0Y8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabrg1Q9R0Y8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabrg1Q9R0Y8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabrg1Q9R0Y8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabrg1Q9R0Y8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabrg1Q9R0Y8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabrg1Q9R0Y8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabrg1Q9R0Y8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabrg1Q9R0Y8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabrg1Q9R0Y8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabrg1Q9R0Y8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabrg1Q9R0Y8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabrg1Q9R0Y8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabrg1Q9R0Y8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabrg1Q9R0Y8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabrg1Q9R0Y8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabrg1Q9R0Y8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabrg1Q9R0Y8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabrg1Q9R0Y8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabrg1Q9R0Y8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabrg1Q9R0Y8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabrg1Q9R0Y8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabrg1Q9R0Y8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabrg1Q9R0Y8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabrg1Q9R0Y8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabrg1Q9R0Y8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabrg1Q9R0Y8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabrg1Q9R0Y8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabrg1Q9R0Y8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabrg1Q9R0Y8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabrg1Q9R0Y8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabrg1Q9R0Y8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabrg1Q9R0Y8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabrg1Q9R0Y8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabrg1Q9R0Y8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabrg1Q9R0Y8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabrg1Q9R0Y8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabrg1Q9R0Y8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabrg1Q9R0Y8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gabrg1Q9R0Y8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabrg1Q9R0Y8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabrg1Q9R0Y8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabrg1Q9R0Y8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabrg1Q9R0Y8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabrg1Q9R0Y8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabrg1Q9R0Y8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabrg1Q9R0Y8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabrg1Q9R0Y8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gabrg1Q9R0Y8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabrg1Q9R0Y8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabrg1Q9R0Y8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabrg1Q9R0Y8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabrg1Q9R0Y8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabrg1Q9R0Y8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabrg1Q9R0Y8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabrg1Q9R0Y8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabrg1Q9R0Y8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabrg1Q9R0Y8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabrg1Q9R0Y8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabrg1Q9R0Y8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabrg1Q9R0Y8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabrg1Q9R0Y8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gabrg1Q9R0Y8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gabrg1Q9R0Y8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms