Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmed2Q9R0Q3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmed2Q9R0Q3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmed2Q9R0Q3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmed2Q9R0Q3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmed2Q9R0Q3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmed2Q9R0Q3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmed2Q9R0Q3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmed2Q9R0Q3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmed2Q9R0Q3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmed2Q9R0Q3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmed2Q9R0Q3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmed2Q9R0Q3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmed2Q9R0Q3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmed2Q9R0Q3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmed2Q9R0Q3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmed2Q9R0Q3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmed2Q9R0Q3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmed2Q9R0Q3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmed2Q9R0Q3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmed2Q9R0Q3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmed2Q9R0Q3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmed2Q9R0Q3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmed2Q9R0Q3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmed2Q9R0Q3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmed2Q9R0Q3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmed2Q9R0Q3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmed2Q9R0Q3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmed2Q9R0Q3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmed2Q9R0Q3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms