Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vav3Q9R0C8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vav3Q9R0C8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms