Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prkab1Q9R078 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prkab1Q9R078 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prkab1Q9R078 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prkab1Q9R078 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prkab1Q9R078 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prkab1Q9R078 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Prkab1Q9R078 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prkab1Q9R078 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prkab1Q9R078 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prkab1Q9R078 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prkab1Q9R078 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prkab1Q9R078 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkab1Q9R078 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkab1Q9R078 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkab1Q9R078 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkab1Q9R078 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkab1Q9R078 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkab1Q9R078 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkab1Q9R078 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkab1Q9R078 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkab1Q9R078 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkab1Q9R078 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkab1Q9R078 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prkab1Q9R078 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prkab1Q9R078 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prkab1Q9R078 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prkab1Q9R078 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prkab1Q9R078 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prkab1Q9R078 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prkab1Q9R078 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prkab1Q9R078 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms