Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ripk3Q9QZL0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ripk3Q9QZL0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ripk3Q9QZL0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ripk3Q9QZL0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ripk3Q9QZL0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ripk3Q9QZL0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ripk3Q9QZL0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ripk3Q9QZL0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ripk3Q9QZL0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ripk3Q9QZL0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ripk3Q9QZL0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ripk3Q9QZL0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ripk3Q9QZL0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ripk3Q9QZL0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ripk3Q9QZL0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ripk3Q9QZL0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ripk3Q9QZL0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ripk3Q9QZL0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ripk3Q9QZL0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ripk3Q9QZL0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ripk3Q9QZL0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ripk3Q9QZL0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ripk3Q9QZL0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ripk3Q9QZL0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ripk3Q9QZL0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ripk3Q9QZL0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ripk3Q9QZL0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ripk3Q9QZL0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ripk3Q9QZL0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ripk3Q9QZL0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms