Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tnnt3Q9QZ47 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tnnt3Q9QZ47 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tnnt3Q9QZ47 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tnnt3Q9QZ47 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tnnt3Q9QZ47 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tnnt3Q9QZ47 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tnnt3Q9QZ47 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tnnt3Q9QZ47 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms