Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYR6

Map1a, Microtubule-associated protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 2,776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map1aQ9QYR6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Map1aQ9QYR6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Map1aQ9QYR6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Map1aQ9QYR6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Map1aQ9QYR6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Map1aQ9QYR6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Map1aQ9QYR6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Map1aQ9QYR6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Map1aQ9QYR6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Map1aQ9QYR6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Map1aQ9QYR6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Map1aQ9QYR6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Map1aQ9QYR6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Map1aQ9QYR6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Map1aQ9QYR6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Map1aQ9QYR6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Map1aQ9QYR6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Map1aQ9QYR6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Map1aQ9QYR6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms