Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tomm40Q9QYA2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tomm40Q9QYA2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tomm40Q9QYA2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tomm40Q9QYA2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tomm40Q9QYA2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tomm40Q9QYA2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tomm40Q9QYA2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tomm40Q9QYA2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tomm40Q9QYA2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tomm40Q9QYA2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tomm40Q9QYA2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tomm40Q9QYA2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tomm40Q9QYA2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tomm40Q9QYA2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tomm40Q9QYA2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tomm40Q9QYA2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tomm40Q9QYA2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tomm40Q9QYA2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tomm40Q9QYA2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tomm40Q9QYA2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tomm40Q9QYA2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tomm40Q9QYA2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tomm40Q9QYA2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tomm40Q9QYA2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tomm40Q9QYA2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tomm40Q9QYA2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.1 ms