Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nphp1Q9QY53 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Nphp1Q9QY53 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nphp1Q9QY53 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nphp1Q9QY53 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nphp1Q9QY53 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nphp1Q9QY53 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nphp1Q9QY53 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nphp1Q9QY53 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nphp1Q9QY53 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nphp1Q9QY53 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nphp1Q9QY53 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nphp1Q9QY53 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Nphp1Q9QY53 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nphp1Q9QY53 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nphp1Q9QY53 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nphp1Q9QY53 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nphp1Q9QY53 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nphp1Q9QY53 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nphp1Q9QY53 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nphp1Q9QY53 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Nphp1Q9QY53 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Nphp1Q9QY53 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nphp1Q9QY53 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nphp1Q9QY53 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nphp1Q9QY53 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Nphp1Q9QY53 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nphp1Q9QY53 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nphp1Q9QY53 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nphp1Q9QY53 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nphp1Q9QY53 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nphp1Q9QY53 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Nphp1Q9QY53 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nphp1Q9QY53 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nphp1Q9QY53 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nphp1Q9QY53 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nphp1Q9QY53 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nphp1Q9QY53 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nphp1Q9QY53 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nphp1Q9QY53 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nphp1Q9QY53 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nphp1Q9QY53 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nphp1Q9QY53 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nphp1Q9QY53 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nphp1Q9QY53 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nphp1Q9QY53 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nphp1Q9QY53 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nphp1Q9QY53 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nphp1Q9QY53 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nphp1Q9QY53 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nphp1Q9QY53 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nphp1Q9QY53 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nphp1Q9QY53 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nphp1Q9QY53 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nphp1Q9QY53 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nphp1Q9QY53 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nphp1Q9QY53 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nphp1Q9QY53 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nphp1Q9QY53 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nphp1Q9QY53 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nphp1Q9QY53 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms