Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 772 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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Pdzd4Q9QY39 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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Pdzd4Q9QY39 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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Pdzd4Q9QY39 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdzd4Q9QY39 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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Pdzd4Q9QY39 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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Pdzd4Q9QY39 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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Pdzd4Q9QY39 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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Pdzd4Q9QY39 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdzd4Q9QY39 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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