Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxe3Q9QY14 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Foxe3Q9QY14 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxe3Q9QY14 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxe3Q9QY14 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxe3Q9QY14 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxe3Q9QY14 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxe3Q9QY14 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Foxe3Q9QY14 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Foxe3Q9QY14 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Foxe3Q9QY14 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Foxe3Q9QY14 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Foxe3Q9QY14 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Foxe3Q9QY14 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Foxe3Q9QY14 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Foxe3Q9QY14 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Foxe3Q9QY14 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Foxe3Q9QY14 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Foxe3Q9QY14 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Foxe3Q9QY14 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Foxe3Q9QY14 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Foxe3Q9QY14 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Foxe3Q9QY14 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Foxe3Q9QY14 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Foxe3Q9QY14 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Foxe3Q9QY14 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxe3Q9QY14 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Foxe3Q9QY14 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Foxe3Q9QY14 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Foxe3Q9QY14 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Foxe3Q9QY14 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxe3Q9QY14 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxe3Q9QY14 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxe3Q9QY14 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Foxe3Q9QY14 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Foxe3Q9QY14 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Foxe3Q9QY14 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Foxe3Q9QY14 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Foxe3Q9QY14 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Foxe3Q9QY14 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Foxe3Q9QY14 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Foxe3Q9QY14 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Foxe3Q9QY14 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Foxe3Q9QY14 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Foxe3Q9QY14 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Foxe3Q9QY14 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Foxe3Q9QY14 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Foxe3Q9QY14 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Foxe3Q9QY14 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Foxe3Q9QY14 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Foxe3Q9QY14 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Foxe3Q9QY14 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Foxe3Q9QY14 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Foxe3Q9QY14 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Foxe3Q9QY14 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxe3Q9QY14 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxe3Q9QY14 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxe3Q9QY14 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxe3Q9QY14 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxe3Q9QY14 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxe3Q9QY14 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxe3Q9QY14 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxe3Q9QY14 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxe3Q9QY14 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxe3Q9QY14 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxe3Q9QY14 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxe3Q9QY14 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxe3Q9QY14 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxe3Q9QY14 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxe3Q9QY14 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxe3Q9QY14 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxe3Q9QY14 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxe3Q9QY14 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxe3Q9QY14 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxe3Q9QY14 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxe3Q9QY14 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxe3Q9QY14 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxe3Q9QY14 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxe3Q9QY14 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxe3Q9QY14 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxe3Q9QY14 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxe3Q9QY14 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxe3Q9QY14 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Foxe3Q9QY14 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Foxe3Q9QY14 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Foxe3Q9QY14 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms