Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Opn4Q9QXZ9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Opn4Q9QXZ9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms