Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PdcQ9QW08 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PdcQ9QW08 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PdcQ9QW08 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PdcQ9QW08 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PdcQ9QW08 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PdcQ9QW08 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PdcQ9QW08 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PdcQ9QW08 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PdcQ9QW08 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PdcQ9QW08 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PdcQ9QW08 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PdcQ9QW08 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms