Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mid2Q9QUS6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mid2Q9QUS6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mid2Q9QUS6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms