Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Psma6Q9QUM9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Psma6Q9QUM9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 339.3 ms