Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms