Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdc42ep4Q9JM96 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdc42ep4Q9JM96 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdc42ep4Q9JM96 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdc42ep4Q9JM96 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdc42ep4Q9JM96 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdc42ep4Q9JM96 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdc42ep4Q9JM96 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdc42ep4Q9JM96 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdc42ep4Q9JM96 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdc42ep4Q9JM96 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdc42ep4Q9JM96 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdc42ep4Q9JM96 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdc42ep4Q9JM96 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdc42ep4Q9JM96 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdc42ep4Q9JM96 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdc42ep4Q9JM96 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdc42ep4Q9JM96 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdc42ep4Q9JM96 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdc42ep4Q9JM96 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdc42ep4Q9JM96 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdc42ep4Q9JM96 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdc42ep4Q9JM96 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdc42ep4Q9JM96 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdc42ep4Q9JM96 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdc42ep4Q9JM96 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdc42ep4Q9JM96 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdc42ep4Q9JM96 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdc42ep4Q9JM96 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdc42ep4Q9JM96 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdc42ep4Q9JM96 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdc42ep4Q9JM96 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms