Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ2

Aldh9a1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh9a1Q9JLJ2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Aldh9a1Q9JLJ2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Aldh9a1Q9JLJ2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms