Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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Tgm1Q9JLF6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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Tgm1Q9JLF6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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Tgm1Q9JLF6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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Tgm1Q9JLF6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tgm1Q9JLF6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
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Tgm1Q9JLF6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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Tgm1Q9JLF6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tgm1Q9JLF6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tgm1Q9JLF6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tgm1Q9JLF6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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Tgm1Q9JLF6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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Tgm1Q9JLF6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tgm1Q9JLF6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tgm1Q9JLF6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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Tgm1Q9JLF6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tgm1Q9JLF6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tgm1Q9JLF6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tgm1Q9JLF6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tgm1Q9JLF6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tgm1Q9JLF6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tgm1Q9JLF6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tgm1Q9JLF6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tgm1Q9JLF6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tgm1Q9JLF6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tgm1Q9JLF6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tgm1Q9JLF6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tgm1Q9JLF6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms