Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

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Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SacsQ9JLC8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SacsQ9JLC8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SacsQ9JLC8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SacsQ9JLC8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SacsQ9JLC8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SacsQ9JLC8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SacsQ9JLC8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SacsQ9JLC8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SacsQ9JLC8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SacsQ9JLC8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SacsQ9JLC8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SacsQ9JLC8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SacsQ9JLC8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SacsQ9JLC8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SacsQ9JLC8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SacsQ9JLC8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SacsQ9JLC8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SacsQ9JLC8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SacsQ9JLC8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SacsQ9JLC8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SacsQ9JLC8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SacsQ9JLC8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SacsQ9JLC8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SacsQ9JLC8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SacsQ9JLC8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SacsQ9JLC8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
SacsQ9JLC8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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SacsQ9JLC8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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SacsQ9JLC8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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SacsQ9JLC8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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SacsQ9JLC8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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SacsQ9JLC8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SacsQ9JLC8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms