Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC6

Tef, Thyrotroph embryonic factor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefQ9JLC6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TefQ9JLC6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TefQ9JLC6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TefQ9JLC6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TefQ9JLC6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TefQ9JLC6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TefQ9JLC6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TefQ9JLC6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TefQ9JLC6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TefQ9JLC6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TefQ9JLC6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TefQ9JLC6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TefQ9JLC6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TefQ9JLC6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TefQ9JLC6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TefQ9JLC6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TefQ9JLC6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TefQ9JLC6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TefQ9JLC6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TefQ9JLC6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TefQ9JLC6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TefQ9JLC6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TefQ9JLC6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TefQ9JLC6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TefQ9JLC6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TefQ9JLC6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TefQ9JLC6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TefQ9JLC6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TefQ9JLC6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TefQ9JLC6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TefQ9JLC6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TefQ9JLC6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TefQ9JLC6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TefQ9JLC6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TefQ9JLC6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TefQ9JLC6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TefQ9JLC6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TefQ9JLC6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TefQ9JLC6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TefQ9JLC6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TefQ9JLC6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TefQ9JLC6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TefQ9JLC6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TefQ9JLC6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms