Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKZ2

Slc5a3, Sodium/myo-inositol cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a3Q9JKZ2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc5a3Q9JKZ2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc5a3Q9JKZ2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc5a3Q9JKZ2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc5a3Q9JKZ2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc5a3Q9JKZ2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc5a3Q9JKZ2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc5a3Q9JKZ2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc5a3Q9JKZ2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc5a3Q9JKZ2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc5a3Q9JKZ2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc5a3Q9JKZ2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc5a3Q9JKZ2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc5a3Q9JKZ2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc5a3Q9JKZ2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc5a3Q9JKZ2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc5a3Q9JKZ2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc5a3Q9JKZ2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc5a3Q9JKZ2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc5a3Q9JKZ2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc5a3Q9JKZ2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc5a3Q9JKZ2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc5a3Q9JKZ2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc5a3Q9JKZ2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc5a3Q9JKZ2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc5a3Q9JKZ2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc5a3Q9JKZ2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc5a3Q9JKZ2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc5a3Q9JKZ2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc5a3Q9JKZ2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc5a3Q9JKZ2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc5a3Q9JKZ2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc5a3Q9JKZ2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc5a3Q9JKZ2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc5a3Q9JKZ2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc5a3Q9JKZ2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc5a3Q9JKZ2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc5a3Q9JKZ2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc5a3Q9JKZ2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc5a3Q9JKZ2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Slc5a3Q9JKZ2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Slc5a3Q9JKZ2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Slc5a3Q9JKZ2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Slc5a3Q9JKZ2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Slc5a3Q9JKZ2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Slc5a3Q9JKZ2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Slc5a3Q9JKZ2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Slc5a3Q9JKZ2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Slc5a3Q9JKZ2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Slc5a3Q9JKZ2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Slc5a3Q9JKZ2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Slc5a3Q9JKZ2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms