Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Upk3aQ9JKX8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Upk3aQ9JKX8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms