Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKL4

Ndufaf3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf3Q9JKL4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ndufaf3Q9JKL4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ndufaf3Q9JKL4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ndufaf3Q9JKL4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms