Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
AtrQ9JKK8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AtrQ9JKK8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms