Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC7

Ap4m1, AP-4 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4m1Q9JKC7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap4m1Q9JKC7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap4m1Q9JKC7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap4m1Q9JKC7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap4m1Q9JKC7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap4m1Q9JKC7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap4m1Q9JKC7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap4m1Q9JKC7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap4m1Q9JKC7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap4m1Q9JKC7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap4m1Q9JKC7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap4m1Q9JKC7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap4m1Q9JKC7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap4m1Q9JKC7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap4m1Q9JKC7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap4m1Q9JKC7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap4m1Q9JKC7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap4m1Q9JKC7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap4m1Q9JKC7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap4m1Q9JKC7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap4m1Q9JKC7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap4m1Q9JKC7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap4m1Q9JKC7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap4m1Q9JKC7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap4m1Q9JKC7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap4m1Q9JKC7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap4m1Q9JKC7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap4m1Q9JKC7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap4m1Q9JKC7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap4m1Q9JKC7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap4m1Q9JKC7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap4m1Q9JKC7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap4m1Q9JKC7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap4m1Q9JKC7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap4m1Q9JKC7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms