Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Ybx3Q9JKB3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ybx3Q9JKB3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ybx3Q9JKB3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ybx3Q9JKB3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ybx3Q9JKB3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ybx3Q9JKB3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ybx3Q9JKB3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ybx3Q9JKB3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ybx3Q9JKB3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ybx3Q9JKB3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ybx3Q9JKB3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ybx3Q9JKB3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ybx3Q9JKB3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ybx3Q9JKB3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ybx3Q9JKB3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ybx3Q9JKB3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ybx3Q9JKB3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ybx3Q9JKB3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ybx3Q9JKB3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ybx3Q9JKB3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ybx3Q9JKB3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ybx3Q9JKB3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Ybx3Q9JKB3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ybx3Q9JKB3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Ybx3Q9JKB3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ybx3Q9JKB3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ybx3Q9JKB3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ybx3Q9JKB3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ybx3Q9JKB3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ybx3Q9JKB3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ybx3Q9JKB3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ybx3Q9JKB3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ybx3Q9JKB3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ybx3Q9JKB3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ybx3Q9JKB3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ybx3Q9JKB3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Ybx3Q9JKB3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ybx3Q9JKB3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ybx3Q9JKB3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ybx3Q9JKB3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ybx3Q9JKB3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ybx3Q9JKB3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ybx3Q9JKB3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ybx3Q9JKB3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ybx3Q9JKB3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ybx3Q9JKB3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ybx3Q9JKB3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ybx3Q9JKB3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ybx3Q9JKB3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ybx3Q9JKB3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ybx3Q9JKB3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ybx3Q9JKB3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ybx3Q9JKB3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ybx3Q9JKB3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ybx3Q9JKB3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ybx3Q9JKB3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ybx3Q9JKB3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ybx3Q9JKB3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ybx3Q9JKB3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ybx3Q9JKB3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ybx3Q9JKB3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ybx3Q9JKB3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ybx3Q9JKB3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ybx3Q9JKB3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ybx3Q9JKB3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ybx3Q9JKB3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ybx3Q9JKB3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ybx3Q9JKB3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ybx3Q9JKB3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ybx3Q9JKB3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ybx3Q9JKB3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ybx3Q9JKB3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ybx3Q9JKB3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ybx3Q9JKB3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ybx3Q9JKB3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ybx3Q9JKB3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ybx3Q9JKB3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ybx3Q9JKB3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ybx3Q9JKB3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ybx3Q9JKB3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ybx3Q9JKB3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ybx3Q9JKB3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ybx3Q9JKB3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ybx3Q9JKB3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ybx3Q9JKB3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ybx3Q9JKB3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Ybx3Q9JKB3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ybx3Q9JKB3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ybx3Q9JKB3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ybx3Q9JKB3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ybx3Q9JKB3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ybx3Q9JKB3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ybx3Q9JKB3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ybx3Q9JKB3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ybx3Q9JKB3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ybx3Q9JKB3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ybx3Q9JKB3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ybx3Q9JKB3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ybx3Q9JKB3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms