Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR9

Nrip3, Nuclear receptor-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip3Q9JJR9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nrip3Q9JJR9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms