Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJQ0

Pigb, GPI mannosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PigbQ9JJQ0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PigbQ9JJQ0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PigbQ9JJQ0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PigbQ9JJQ0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PigbQ9JJQ0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PigbQ9JJQ0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PigbQ9JJQ0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PigbQ9JJQ0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PigbQ9JJQ0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PigbQ9JJQ0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PigbQ9JJQ0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PigbQ9JJQ0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PigbQ9JJQ0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PigbQ9JJQ0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PigbQ9JJQ0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PigbQ9JJQ0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PigbQ9JJQ0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PigbQ9JJQ0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PigbQ9JJQ0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PigbQ9JJQ0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PigbQ9JJQ0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PigbQ9JJQ0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PigbQ9JJQ0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PigbQ9JJQ0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PigbQ9JJQ0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PigbQ9JJQ0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PigbQ9JJQ0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PigbQ9JJQ0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PigbQ9JJQ0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PigbQ9JJQ0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PigbQ9JJQ0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PigbQ9JJQ0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PigbQ9JJQ0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PigbQ9JJQ0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PigbQ9JJQ0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PigbQ9JJQ0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PigbQ9JJQ0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PigbQ9JJQ0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PigbQ9JJQ0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PigbQ9JJQ0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PigbQ9JJQ0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PigbQ9JJQ0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PigbQ9JJQ0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PigbQ9JJQ0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PigbQ9JJQ0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PigbQ9JJQ0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PigbQ9JJQ0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PigbQ9JJQ0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PigbQ9JJQ0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PigbQ9JJQ0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PigbQ9JJQ0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PigbQ9JJQ0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PigbQ9JJQ0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PigbQ9JJQ0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PigbQ9JJQ0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PigbQ9JJQ0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PigbQ9JJQ0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PigbQ9JJQ0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PigbQ9JJQ0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PigbQ9JJQ0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PigbQ9JJQ0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PigbQ9JJQ0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PigbQ9JJQ0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PigbQ9JJQ0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PigbQ9JJQ0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PigbQ9JJQ0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PigbQ9JJQ0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PigbQ9JJQ0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PigbQ9JJQ0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PigbQ9JJQ0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PigbQ9JJQ0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PigbQ9JJQ0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PigbQ9JJQ0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PigbQ9JJQ0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PigbQ9JJQ0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PigbQ9JJQ0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PigbQ9JJQ0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PigbQ9JJQ0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PigbQ9JJQ0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PigbQ9JJQ0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PigbQ9JJQ0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PigbQ9JJQ0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PigbQ9JJQ0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PigbQ9JJQ0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PigbQ9JJQ0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PigbQ9JJQ0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PigbQ9JJQ0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PigbQ9JJQ0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PigbQ9JJQ0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PigbQ9JJQ0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PigbQ9JJQ0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PigbQ9JJQ0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PigbQ9JJQ0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PigbQ9JJQ0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PigbQ9JJQ0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PigbQ9JJQ0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PigbQ9JJQ0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PigbQ9JJQ0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PigbQ9JJQ0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PigbQ9JJQ0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms